一般来说造成睾丸一高一低的原因有以下两种。
第一种，在胚胎发育过程中，双侧睾丸随着胚胎发育，自腹膜后肾脏区域逐渐降至双侧阴囊内，在下降的过程中由于受阻，导致有一侧或者双侧睾丸不能降入阴囊中，这种情况称之为隐睾。
第二种，可能是双侧睾丸随着提睾肌收缩，也会造成双侧睾丸高低不一样的情况，其中还有单侧精索静脉曲张。