输尿管畸形可以通过手术进行治疗，具体分析如下：
1、如果输尿管畸形，此时无肾积水，无尿液引流障碍，临床上无需治疗。但是，腰痛、肾功能损害、肾积水等情况下，可以通过外科手术，将反复的输尿管或积水的上位肾盂切除。
2、巨输尿管病，由于运动引起的同侧肾积水，时间长了很容易造成同一侧的肾功能减退。治疗时要考虑到输尿管的切除。
3、肾盂、输尿管先天狭窄，肾盂积水会导致肾功能受损。目前的治疗方法仍然是外科，即通过手术，将狭窄的部分切除，并进行输尿管端端吻合术，以确保输尿管通畅，预防肾积水。