尿道口长了一个小肉芽可以通过物理治疗、饮食调理、药物治疗等方式进行治疗，具体分析如下：
尿道口长了一个小肉芽，如果近期有过不洁的性接触史，首先要考虑是人乳头瘤状病毒感染引起的性传播疾病，建议到医院泌尿外科门诊做个小手术，用激光或者电灼切除这个小肉芽，然后局部涂抹干扰素软膏，以提高局部免疫力，彻底杀灭病毒，避免复发。避免吃辛辣刺激的食物，避免饮酒和海鲜。