龟头根部痒有白色污垢可能是多种原因导致的，具体分析如下：
龟头根部出现了一些白色的污物，这是因为包皮垢在龟头的底部堆积的缘故。如果是真菌包皮龟头炎引起的龟头根部瘙痒伴有白色污垢。龟头根位于冠状沟，由于冠状沟比较凹陷，容易产生炎症，感染后局部会有瘙痒、疼痛等症状，清理干净后可以发现里面的皮肤是红色的。