阴茎根部刺痛可能是睾丸炎、附睾炎、尿道炎、前列腺炎等原因导致的，具体分析如下：
阴茎根部刺痛主要是由于睾丸炎、附睾炎、尿道炎、前列腺炎等原因所致。可以口服炎克宁胶囊、左氧氟沙星片等药物，避免饮酒，避免辛辣刺激性的食物，如果治疗无效，应及时到医院的泌尿外科做进一步的检查。要控制性生活频率，避免经常自慰。