一般来说，包皮上长的水泡主要原因有生殖器疱疹以及包皮龟头炎，需要根据实际情况进行消除。具体分析如下：
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起，可以引起包皮水泡，患者可以在医生的指导下使用阿昔洛韦乳膏进行治疗，可以出现消除。包皮龟头炎一般与包皮过长、局部卫生差等因素有关，患者可以在医生的指导下使用碘伏清洗包皮及龟头，然后在医生的指导下口服头孢类抗生素，感染控制后水泡可消失。
此外，如果症状严重应该及时前往医院就诊治疗，以免耽误病情。