生殖器瘙痒的主要病因主要包括以下几点：
包皮龟头炎、阴囊炎、阴囊湿疹、生殖器尖锐湿疣、生殖器疱疹等因素都有可能会导致生殖器痒。包皮龟头炎的炎症部位是包皮和龟头，也会出现瘙痒症状，阴囊的两侧阴囊瘙痒是因为炎症的原因。
并且患者患有阴囊湿疹还会引起局部瘙痒，如生殖器尖锐湿疣后期会瘙痒，而生殖器疱疹在出泡前和出泡后也会有瘙痒感。