附睾畸形的治疗方法有药物治疗、手术治疗等，具体分析如下：
1.药物治疗：在不育手术中通常会发现附睾畸形，因此可以通过口服促进精子产生、改善和替代治疗的药物，以及由于男性睾丸内分泌功能低下而导致的疾病。十一酸睾酮是目前临床上比较常见的口服药物，可以在短时间内缓解男性不孕，但是如果长期使用十一酸睾酮，则会对精子产生有一定的影响。不良反应包括皮疹、痤疮、白细胞减少、水钠潴留、恶心、呕吐、厌食、腹泻等。
2.手术治疗：附睾管输精管吻合术是节段性附睾闭锁的首选方法。本术式是在放大10-20倍的显微镜下，将膨胀的附睾管切开，从断端取出粘液，寻找精子。