生殖器有小肉粒可以通过物理治疗、饮食调理等方式进行治疗，具体分析如下：
生殖器上出现小肉粒，如果最近有过不干净的性生活，可能是因为人乳头瘤状病毒所致的尖锐湿疣，需要到正规的医院泌尿外科进行激光、电灼等手术，将这些肉粒去掉，然后在皮肤上涂上干扰素软膏，可以将体内的病毒完全排出体外，防止以后复发。在治疗过程中，不能同房，不能吃辛辣刺激性食物，不能饮酒、不能进食海鲜。