大腿根部和阴囊瘙痒可能是阴囊湿疹导致的，也可能是真菌感染所致的股癣引起的，患者需要做详细的检查以确定具体病因，在医生指导下对症进行治疗。具体情况分析如下：
如果是患有阴囊湿疹，可以先用复方苦参洗剂进行清洁，然后再外用一些药物，例如红霉素软膏、地塞米松软膏等。股癣可以外用克霉唑软膏、酮康唑软膏等具有抗霉菌作用的药物。