通常情况下，阴茎3厘米长只有通过手术的方式进行治疗。具体内容如下：
一个成年男性的阴茎只有三厘米长，通常是不正常的，可能性先天性发育问题，或者是处于青少年时期，长期有自慰的习惯导致的阴茎短小。三厘米长的阴茎，只能考虑通过手术治疗，建议去正规的医院挂泌尿科就诊，做阴茎延长术。
手术恢复期间，忌酒精、辛辣食品摄入。日常生活中多食用清淡食物，可以多吃水果、新鲜的蔬菜等。保证每日饮水量，保持尿路通畅。