目前，不同的治疗手段对毛孔角化症的疗效并不理想，没有一种有效的治疗手段可以预防其再次发生。
一、药物疗法
1、可以外用10%的水杨酸软膏或0.05%-0.1%维A酸软膏，外用氟尿嘧啶封包，一般3个星期内就可以完全恢复，角化角质可以通过角质溶蚀剂来缓解。
2、口服阿维A，阿维A或异维A酸会在用药期间起作用，2周后起作用，3个月后效果明显，但停药后又会出现反复。
二、手术治疗
可以选择磨削、手术切除等方法。其主要目标是去除皮肤角化区，改善已皮肤焦化情况，使皮肤外观得到改善。
三、物理治疗
冷冻疗法、电离子激光、刮除术是治疗皮损较小、需要快速治疗或提高外观、并可进行治疗的皮损。