尿道长小疙瘩可根据不同情况进行治疗，具体如下：
1.如果是因为炎症或病毒感染引起的尿道长小疙瘩，可以用碘伏进行杀菌，或者用派瑞松软膏进行消炎处理。
2.如果是由于病毒感染引起的尿道长小疙瘩，通常会出现尖锐湿疣，需要控制自己的性行为。
3.这类患者平时需避免食用辛辣刺激的食品，可应用激光、冰冻等手段消除尿道上的小疙瘩。
4.患者可外用干扰素软膏进行抗菌处理、服用转移因子口服液来预防症状复发。