一般情况下，肛门毛囊炎可以在医生指导下使用药物进行治疗，具体内容如下：
肛周的毛囊炎因为其位置比较特别，很容易被粪便所沾染，因此要经常清洗，保持局部的干净，经常更换内衣，可以用1:8000的高锰酸钾溶液进行坐浴，然后涂夫西地酸乳剂或多粘菌素b软膏，百多邦软膏，氧氟沙星凝胶等。病情较严重的患者可以服用一些抗生素。不要吃辛辣和刺激性的食物，不要喝酒。