一般情况下，肛门有疙瘩、疼可能是外痔、肛周脓肿、肛瘘等因素造成的，具体他内容如下：
1.外痔：如果患者患有外痔，如炎性外痔、血栓性外痔等，肛门处可能会出现质地较硬的疙瘩，导致患者感觉肛门有疙瘩、疼。
2.肛周脓肿：如果患者存在肛周脓肿，通常会有肛周红肿、疼痛、坠胀等不适症状，可能出现肛门有疙瘩、疼的症状，可能会影响患者坐卧，甚至可能出现体温升高、全身乏力等不适症状。
3.肛瘘：如果患者患有肛瘘，多有肛周肿胀、流脓等不适症状，可能出现肛门有疙瘩、疼的情况，患者应及时行肛瘘切除术进行治疗。