通常情况下，肛门起个肉疙瘩有点疼可能是痔疮、肛门息肉等原因导致的，不同原因可采取不同的治疗方式。具体情况分析如下：
1.痔疮：痔疮是发生于肛门齿线上下的病变，患者一般会出现便血、痔块脱垂、肛门瘙痒等症状，因此肛门起个肉疙瘩有点疼可能是痔疮导致的。患者可以按照医嘱使用地榆槐角丸、痔疮栓、痔速宁片等药物进行治疗。
2.肛门息肉：肛门息肉是指发生在直肠黏膜或者肛管上的隆起性病变，患者一般会出现便血、肛门突出物、腹泻等症状，所以肛门起个肉疙瘩有可能是肛门息肉导致的。患者可以通过经肛门息肉切除术、内镜下圈套切除术、活检钳钳除术等方式进行治疗。