通常情况下，指甲盖有黑色竖线是甲母痣、外伤等导致的。具体分析如下：
1.甲母痣：甲母痣是痣的一种，其病因目前尚不明确。患者以指甲盖上有宽度及色泽均匀一致的黑色竖纹为主要表现。一般无需特殊治疗，但需定期观察；如果黑色竖线有明显变粗、色素不均、疼痛等倾向，需要及时去正规医院进行检查，排除恶性病变。
2.外伤：若是由于外伤引起的血管破裂而甲下有出血时，血液淤积在局部，所以会表现为局部为青紫或有黑色竖线。