通常情况下，粪便中出现真菌感染，一般都是由肠道菌群引起的，并不一定是真菌感染。真菌感染属于机会性感染，人体内有真菌，但如果身体不正常，或是大量使用抗生素，可能会造成真菌的过量繁殖。
在日常生活中，不能过量使用抗生素，也不能滥用抗生素，可以通过服用益生菌进行调理，一般情况下可以自行恢复。真菌感染会随着身体的免疫力的恢复而自动愈合，在日常生活中也不需要太过担心。