糠秕孢子菌的毛囊炎与痤疮有如下不同之处：
1、发病部位：糠秕孢子菌毛囊炎多见于胸背皮层较多的部位，多见于免疫抑制病人，如激素病人；痤疮主要发生在面部、颈部，少数还会累及胸背部，这与人体的雄激素水平有关。
2、皮疹的形式，糠粉孢子菌毛囊炎是一种常见的毛囊炎症的圆形丘疹，除了这些皮疹，还有结节、囊肿、瘢痕、窦道、闭口粉刺等。
3、实验室检查：化验真菌化验中糠粉孢子菌呈阳性，痤疮为阴性。