一般来讲，生殖器上有小水泡，主要是由于生殖器疱疹病毒引起的，这种病毒会通过性接触传染，感染后会在阴茎、阴囊、冠状沟、外阴、腹股沟、肛门等处长出透明的小水泡，水泡内液体清澈，但伴有明显的瘙痒和刺痛，可以使用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物进行抗病毒治疗，局部使用干扰素软膏进行抗病毒治疗，一般情况下10天左右就会好转。