红斑狼疮最严重的是合并了相关脏器以及系统的损害。
红斑狼疮属于结缔组织病当中的一种，可会累及多系统以及多器官，如果累及到了肾脏，可会导致肾脏损害，甚至导致肾功能衰竭；累及到心脏可能会出现各种心律失常以及心功能衰竭等；累及到血液系统可能会使红细胞、白细胞、血小板等降低。
红斑狼疮的治疗周期比较长，患者要坚持用药，尽量减小此病对人体器官的损伤。