柯萨奇病毒所致的咽峡炎疱疹是一种以口腔粘膜为特征的慢性感染性炎症。治疗的主要方法是对症外敷及口服抗病毒药物。如病毒唑、阿昔洛韦、干扰素、更昔洛韦等均可用于治疗。也可以口服金银花颗粒、板蓝根颗粒、大青叶合剂等中药。如果溃疡面上有细菌感染，可以口服青霉素或者是头孢类的抗生素。还可以喷金喉健、西瓜霜、锡类散等，以加速病情的恢复。