一般情况下，肛门旁边肉里长疙瘩，疼，可能是疖肿、肛周脓肿等原因引起的。具体内容如下：
1.疖肿：疖肿一般是由金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌等致病菌感染引起的，可能会导致患者肛门旁边肉里长疙瘩，疼。
2.肛周脓肿：肛周脓肿一般是指直肠肛管周围软组织内或其周围间隙发生的急性化脓性感染并形成的脓肿，可能会导致患者肛门旁边肉里长疙瘩，疼。