一般情况下，手背扁平疣可以采用外用药物、口服药物、物理治疗等方式祛除。
1.外用药物：手背扁平疣患者，可以遵医嘱使用地奈德乳膏、丙酸氯倍他索乳膏、氟尿嘧啶乳膏等药物。
2.口服药物：手背扁平疣可能是脾虚引起的，患者可选用口服归脾丸、参苓白术散、附子理中丸等药物。或服用鲜马齿苋、黄连、黄柏、金银花、紫草、连翘、地肤子、白鲜皮等中药。
3.物理治疗：对于手背扁平疣，还可以选择冷冻和激光照射。