通常情况下，喉咙两侧有疙瘩喉咙起泡可能是、滤泡性咽炎、咽喉溃疡等病引起的。具体情况分析如下：
滤泡性咽炎：滤泡性咽炎是咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织的弥漫性炎症，患者一般会出现灼热、咽后壁滤泡增生、咽痛等症状，因此喉咙两侧有疙瘩喉咙起泡可能是滤泡性咽炎导致的。患者可以按照医嘱使用薄荷喉片、西瓜霜润喉片、碘甘油等药物进行治疗。
咽喉溃疡：咽喉溃疡是以咽喉部溃疡且灼热疼痛为主要特征的疾病，严重者会出现口腔溃疡、淋巴结肿大、咽喉疼痛等症状，因此喉咙两侧有疙瘩喉咙起泡可能是咽喉溃疡导致的。患者可可以按照医嘱使用黄栀花口服液、桂林西瓜霜胶囊、阿莫西林胶囊、清火的中成药，粘膜溃疡膏等药物进行治疗。