手上长透明小水疱的原因很多，需要根据原因来治疗。
首先，要考虑的手部的病毒感染性引起的水疱，包括手部的全身性水痘、手足口病等，以及手部的单纯疱疹水疱。患者可外用干扰素凝胶、阿昔洛韦等抗病毒药物。如果水泡破裂，可以外用碘伏、百多邦软膏等。
手部湿疹和汗疱疹是比较常见的，这种水疱属于过敏性反应性水疱，一般建议先用硼酸液湿敷，待水疱干燥后再外用含糖皮质激素的软膏，如派瑞松霜。另一种是手部真菌感染引起的水疱型手癣，可以使用达克宁霜等抗真菌药物，治疗水疱性手癣。