一般来说，小儿蛋白质-能量营养不良的高发人群是儿童，而高发儿童有以下症候人群：
（1）营养摄入不足的婴幼儿，如偏食、挑食易造成的营养不良，可能会导致小儿蛋白质-能量营养不良。
（2）存在消化系统感染或慢性消耗性疾病的婴幼儿，体内能量消耗比较正常儿童更大，更容易出现小儿蛋白质-能量营养不良。
（3）存在先天性疾病的患儿，如先天性消化道畸形、恶性肿瘤等，可能会导致患儿营养摄入不足，进而可能会导致小儿蛋白质-能量营养不良。