一般情况下，小儿衣原体肺炎要做衣原体抗体检查、血常规、痰液咽拭等。
1、衣原体抗体检查：诊断标准为双份血清抗体滴度4倍以上升高。
2、血常规：血白细胞总数一般正常，嗜酸性粒细胞增多。
3、痰液咽拭|可以从中分离出肺炎衣原体。还可以用PCR的方法对呼吸道标本进行DNA扩增，寻找衣原体感染的证据，进行明确诊断。