一般情况下，儿童肾病综合征病因及发病机制目前尚不明确。
1、免疫系统异常：免疫力低，包括细胞免疫、体液免疫和补体，补体低是肾病综合征症状也是发病原因之一。2、儿童继发性肾病综合征：主要是由于全身性疾病、临床诊断明确的肾小球肾炎以及药物、金属中毒等原因引起肾脏损害而出现肾病综合征。3、感染：免疫系统异常导致免疫力下降，细菌、病毒、支原体甚至真菌、寄生虫等趁虚而入，导致感染。