一般情况下，肾静脉血栓形成的病因非常复杂。
1、各种原因导致的血液高凝状态：比如较大儿童主要见于肾病综合征，其他如系统性红斑狼疮继发或原发的抗磷脂综合征等。
2、肾静脉血流障碍：可能是继发性小儿肾静脉血栓形成，小儿多见于单纯性肾病复发后转为难治性者。继发于下腔静脉血栓或肾静脉、下腔静脉因外部肿瘤压迫所致者，如腹主动脉瘤、肾细胞癌及淋巴网状肿瘤等。