一般情况下，小儿慢性淋巴细胞性甲状腺炎要做血清甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体、甲状腺的功能测定、甲状腺超声波显像等检查。
1、血清甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体：甲状腺功能正常时甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体滴度显著增高，是最有意义的诊断指标。
2、甲状腺的功能测定：血清tsh的浓度测定，血清tsh水平可反映患者的代谢状态，一般甲状腺功能正常者的tsh正常，甲减的时候可能会升高。
3、甲状腺超声波显像：示腺体内部超声回声减弱、欠均匀、呈弥漫性改变。