一般情况下，小儿透析失衡综合征主要是对症治疗，根据患者的临床症状进行治疗，可通过减慢透析速度、防止血浆渗透压减低等方式进行治疗，同时可调整透析过程。
1.减慢透析速度：通过减慢人工肾透析速度，特别是多次透析时更宜减慢，但影响透析疗效不易被采纳。
2.防止血浆渗透压减低：可以通过加用高张果糖、葡萄糖、或径加入透析液中，以弥补因透析而发生的血浆渗透压减低的反应，但此法易导致高血糖渗透压血症，因而不易掌握。