一般情况下，小儿选择性IgA缺乏症的治疗方法有药物治疗。
小儿选择性IgA缺乏症多数可自然痊愈，常在5岁以内IgA水平达到正常，无特效治疗方法，适当抗感染治疗为主，免疫增强剂，如黄芪、克雷白杆菌糖蛋白提取物、转移因子口服溶液、重组细胞因子等促进IgG亚类产生的效果还需进一步证实。在发生感染时，应给予适当抗感染药物继发性IgG亚类缺陷者，应针对原发病因进行治疗，如营养紊乱者经矫正后，即可恢复正常。