婴儿痉挛症的原因比较复杂，可以由特发性婴儿痉挛症、产伤、胎儿期疾病等因素引起。
1、特发性婴儿痉挛症：未发现明确病因及其他神经系统症状和体征，可能有家族史。
2、产伤：是婴幼儿痉挛症的常见原因，产钳助产、胎头吸引器吸引、头盆不称、胎位异常、胎儿过大、产程过长、初产妇年龄过大等都可能造成产伤。
3、胎儿期疾病：各种脑炎、脑膜炎、脑脓肿病、.脑血吸虫、脑囊虫病、颅内肿瘤、脑血管畸形、外伤， 痊愈后部分孩子可有婴儿痉挛症后遗症。