一般情况下，小儿选择性IgA缺乏症可能是与遗传、药物以及感染等因素有关。
1、小儿原发性选择性IgA缺陷症大多数为散发病例，但也有常染色体显性或隐性遗传的报告。
2、药物反应：苯妥英钠、金制剂、青霉胺和其他药物可能会引起患者药物诱导的免疫反应。
3、小儿继发性选择性IgA缺陷症可能是与用药引起的自身抗体反应有关，可继发于病毒感染。