小孩膝盖窝疼的原因很多，如下：
1.受伤：小孩受伤后，皮下的毛细血管可能会破裂，从而出现该症状，可以在医生的指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物来涂抹，同时不要用手抓挠患处，以防感染。
2、腘窝囊肿：表现为在腘窝处的质软肿物，有时可伴有疼痛和不适。如确诊为腘窝囊肿，建议患者选择手术的方法来治疗。