一般来说，不同致病微生物导致的小儿支气管肺炎，首选的药物也是不同的。
如果是细菌感染引起的小儿支气管肺炎，可以在医生指导下选择头孢克肟，以及头孢克洛等相关的抗生素进行治疗。如果患者对头孢、青霉素等过敏，可以选择阿奇霉素。如果是支原体等非典型致病菌而引起的支气管肺炎，可以在医生指导下选择红霉素、罗红霉素、阿奇霉素等进行治疗。
确诊为小儿支气管肺炎时，建议根据症状进行止咳、退热等相关的治疗。