宝宝反复发烧39.1度，可以通过物理治疗、口服退烧药等方式处理。具体分析如下：
1.物理治疗：宝宝反复发烧39.1度属于高烧，可以通过贴降温贴、温水擦浴或者洗个温水澡等方式进行物理治疗，辅助降温、退烧。
2.口服退烧药：宝宝反复发烧39.1度应该及时口服布洛芬或者对乙酰氨基酚等退烧药治疗，吃了退烧药之后要多喝水。
家长应该在医生的指导下使用药物，注意观察身体的变化，以免影响生长和发育。