新生儿阴囊两侧大小不对等，通常是鞘膜积液导致的。具体情况分析如下：
鞘膜积液在新生儿期比较常见，这是因为胎儿睾丸从腹膜后间隙下降时，由腹股沟管形成的盲袋也会通过腹股沟管进入阴囊，在发育过程中，除了睾丸周围的鞘膜间隙外，其他部位的鞘膜都会在胎儿出生之前闭合，如果闭合不全，就会出现不同类型的鞘膜积液。鞘膜积液一般预后较好，新生儿出生后一岁前有可能自愈。与腹股沟斜疝、睾丸肿瘤相鉴别，如腹股沟斜疝，透光试验阴性，无嵌顿，可纳入腹腔。有时睾丸肿瘤呈实质状，透光试验亦为阴性。但是最好去医院就诊，由医生做出鉴别诊断。