通常情况下，小儿软骨外胚层发育不全综合征是遗传因素、环境因素等引起的。具体分析如下：
小儿软骨外胚层发育不全综合征是由于外胚层基因突变或者环境影响致使分化偏离正常而导致的长骨生长板增殖缺陷，是一种常染色体的隐性遗传性的疾病，是由于外胚层基因突变或者是环境影响，致使分化偏离正常而导致的，此外，母亲孕期服用某些致畸药物或接触有害物质，可诱发该病的发生，