小孩甲型流感高烧40℃可以通过以下方式来处理：
1.立即退热，口服布洛芬或对乙酰氨基酚。
2.同时给予物理降温方法如贴降温贴、温水洗澡或洗温水澡，帮助退烧。
3.给孩子喝水，或添加低渗口服补液盐，以纠正高烧和脱水。
4.给予抗甲型流感病毒药物治疗，通常选择奥司他韦或阿比朵尔口服。
5.可以同时服用清热解毒的中成药。