三个月宝宝吃益生菌可以在三个月宝宝配方奶粉中添加一些益生菌，让其充分溶解后再喂食。父母还可以将其放入温水中，水温不宜高于40℃，因为这是一种活性微生物，一旦遇到温度升高，就会失效。给三个月宝宝喂食后20-30分钟能有效发挥药效，可以起到一定的作用，可以帮助宝宝增强消化能力，减轻身体的不适。父母给宝宝喂奶粉的时候注意少量多次。