3个多月的宝宝便秘严重可以通过使用药物、物理治疗、饮食调理等方法进行治疗。如果宝宝便秘比较严重，可以给宝宝使用四磨汤口服液、乳果糖口服液等药物，可以缓解便秘的情况。另外也可以对宝宝的腹部进行热敷或者按摩，可以增加肠胃蠕动，减少便秘。同时家长要注意饮食规律，对吃清淡、易消化的食物，少吃辛辣刺激的食物，以免通过乳汁对宝宝造成影响。