一般情况下，小儿肺炎链球菌肺炎要做体格检查、血常规、C反应蛋白测定、尿常规、病原菌检查、血清学检查等检查。
1.体格检查：根据胸腔症状的初步判断，初期仅是轻微的叩诊声或微弱的呼吸声。病程2~3天，肺实变后出现明显的叩诊浊音、语颤增强和管状呼吸音，偶尔可见罗音。临床上，肺功能指标无明显改变，但术后恢复时出现的湿罗音增加，个别患者无明显的胸腔表现。
2.血常规：主要是为了确定小儿的感染和感染的情况，这种疾病的患者的白细胞总数会升高。
3. C-反应蛋白检测： C-反应蛋白的检出率可达到96%，用于诊断儿童的急性感染。
4.尿常规：对小儿进行尿检，检查是否含有少量的蛋白质，以便诊断。
4.病原菌检查：通过呼吸道分泌物、血液和胸腔积液的培养，可以发现感染的细菌。痰液涂片、镜下观察，如有革兰阳性、成对排列的双球菌，痰和血液中有无肺炎链球菌的增殖可以确诊，但阳性率较低。
6.血清学检查：10%~30%的小儿感染了肺炎，而对其病因的鉴别主要是依靠血清学检测。通过测定小儿血清、尿液、尿液中的肺炎链球菌抗体，同时采集血、尿标本，用 CIE、 LA等方法测定。