新生儿单纯疱疹病毒感染可采用隔离、避免搔抓等常规疗法，并与阿昔洛韦、万乃洛韦、泛昔洛韦、炉甘石洗剂等抗组胺药联合用药。具体是这样的：
一、总体治疗
1.儿童应在所有的皮疹结痂和干燥前进行隔离。
2.患儿发热时要多注意休息，多饮水，多进食易消化的食品，注意保持皮肤的干净，避免抓破疱疹，要剪短指甲，并在手指上缠上纱布。
二、药物治疗
1.阿昔洛韦是治疗新生儿单纯疱疹感染的首选药物。
2.泛昔洛韦、万乃洛韦具有较高的生物利用率和较好的疗效。
3.如果有皮疹，可以外用炉甘石洗剂或者是口服抗组织胺药。
4.如果疱疹破裂或继发感染，可以在局部涂抹抗生素。三、手术治疗不需要手术。