一般情况下，青少年及小儿阴道透明细胞癌，考虑是母亲在孕期接受雌激素治疗引起的。
女性对青春期和儿童的阴道透明细胞癌的发生有很大的影响。孕妇怀孕3个月以内服用雌性激素是比较常见的原因。肿瘤细胞的致癌性因素可持续10-20年，在青少年时期，由于体内雌性卵巢分泌的内源性荷尔蒙会引起该种疾病。孕妇在怀孕期间曾服用过雌性激素，其中的己烯雌酚可能会产生阴道癌的不良反应。孕妇怀孕3个多月时服用雌性激素，即便只服用1-2个月，其子代中出现阴道透明上皮的几率也比未服用过的女性高得多。