3个月的婴儿睡觉老是摇头可能是湿疹、佝偻病等原因导致的，需要可以对症治疗，具体内容如下：
1.湿疹：如果婴儿头部出现湿疹，可能会引起局部瘙痒，婴儿可能会通过摇头的方式缓解局部瘙痒的症状，从而出现3个月的婴儿睡觉老是摇头的情况。可以在医生的指导下使用维生素B6软膏、醋酸地塞米松乳膏、维生素C片等药物进行治疗，还可以使用硼酸溶液进行冷敷。
2.缺钙：由于缺乏维生素D或钙元素，影响脑神经系统的发育，容易出现3个月的婴儿睡觉老是摇头的情况，婴儿可以吃富含维生素D的食物，如鸡蛋羹、牛奶等。