一般情况下，患有手足口病高烧到39摄氏度，可以通过使用药物。日常护理等方式进行处理，具体内容如下：
有手足口病的宝宝高烧到39摄氏度时家长首先不要慌张，可以在医生的指导下给宝宝服用布洛芬或者对乙酰氨基酚，可以起到退热的作用，然后家长可以给宝宝多喂水，松开宝宝的衣服，还可以用湿毛巾擦拭宝宝的身体，以便身体散热。然后家长可以尽快带宝宝就医。有手足口病的患儿大多数是可以痊愈的，但是家长需要警惕重症病例，家长平时应做好宝宝个人的卫生护理，有利于身体健康。