通常情况下，阴茎有时缩到3厘米不是肾阳虚导致的。具体情况分析如下：
肾阳虚是由于身体阳虚所导致的虚寒性的病症，劳伤过度、先天不足、久病不愈等因素都有可能会导致肾阳虚，患者一般会出现腰膝酸软冷痛、面色淡白或晦暗，怕冷，肢体不温等症状，因此阴茎有时缩到3厘米不是肾阳虚导致的。阴茎有时缩到3厘米需要到医院进行检查明确到底是什么情况导致的，再针对性进行治疗。