经常在凌晨两三点醒来可能是睡眠障碍导致，具体分析如下：
出现这种情况的主要原因包括：1、神经衰弱，主要是因为工作压力大、精神高度紧张等。2.更年期综合征，45岁以后，女性体内的雌性激素分泌会降低，从而引起神经系统的兴奋，出现经常在凌晨两三点醒来的情况。3.身体的疾病导致的，比如肝脏和肾脏的功能不正常，会导致睡眠提前醒来。